Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
COG3Q96JB2 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
COG3Q96JB2 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms