Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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CCDC142Q17RM4 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC142Q17RM4 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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