Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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CYTH1Q15438 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CYTH1Q15438 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CYTH1Q15438 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CYTH1Q15438 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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