Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RFTN1Q14699 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RFTN1Q14699 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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