Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms