Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ITGB3BPQ13352 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ITGB3BPQ13352 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms