Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FAM3AP98173 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms