Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PGGT1BP53609 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
PGGT1BP53609 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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PGGT1BP53609 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PGGT1BP53609 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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