Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD12P35452 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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