Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR4266-201ENST00000583300 55 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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