Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
COL24A1Q17RW2 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms