Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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