Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FAM187BQ17R55 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms