Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

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Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ERCC6Q03468 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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ERCC6Q03468 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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ERCC6Q03468 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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ERCC6Q03468 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ERCC6Q03468 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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