Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms