Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ING4-206ENST00000444704 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL136376.1-201ENST00000449303 515 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PHBP12-201ENST00000453979 811 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL843P-201ENST00000485262 297 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA1P38-201ENST00000523612 957 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KRT18P59-201ENST00000524879 1231 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CSRP1-209ENST00000526723 574 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC126323.1-201ENST00000561706 611 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC016168.2-203ENST00000563583 623 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC011467.3-201ENST00000599738 429 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC002094.4-201ENST00000613598 307 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC007450.2-201ENST00000614160 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TTI2-202ENST00000431156 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MPP4-212ENST00000620095 2364 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ATP8B5P-201ENST00000329395 2869 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ST7L-203ENST00000360743 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 C16orf62-205ENST00000513947 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BORA-206ENST00000613797 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GTF2H3-214ENST00000618160 3252 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 VWFP1-201ENST00000457911 2907 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC016526.3-201ENST00000624275 3931 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SWT1-201ENST00000367500 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB5-202ENST00000357370 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB12-201ENST00000458643 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB4-208ENST00000537951 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB3-210ENST00000542817 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPB13-202ENST00000543463 1342 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KDM4D-202ENST00000536741 2737 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SEC14L3-203ENST00000402286 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SIDT2-203ENST00000431081 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CHRNA6-205ENST00000534622 1872 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC092017.4-202ENST00000638931 2006 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC060780.1-203ENST00000634503 2406 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MAGEB6-201ENST00000379034 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RBBP8-204ENST00000399722 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TGIF2LX-201ENST00000283891 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IGHV1-69-201ENST00000390633 412 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MYOSLID-201ENST00000430494 974 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL031597.1-201ENST00000447383 432 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IGHV3-64-201ENST00000454421 431 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL442663.1-201ENST00000478589 364 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC025752.1-201ENST00000503317 558 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC091940.1-201ENST00000515519 756 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ST3GAL4-219ENST00000534457 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TGIF2LX-202ENST00000561129 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ASIP-202ENST00000568305 610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC006213.3-201ENST00000586247 517 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC011467.5-201ENST00000597392 996 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL031719.2-201ENST00000624488 476 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms