Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 THPO-201ENST00000204615 1855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC012409.5-201ENST00000624746 3424 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 CD302-201ENST00000259053 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 ASH2L-202ENST00000428278 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC009021.2-201ENST00000567401 1666 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 MROH8-203ENST00000400441 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 RUNX1T1-204ENST00000422361 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 SNAP25-AS1-207ENST00000603542 3207 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 TTLL5-201ENST00000286650 1595 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 KCNIP1-204ENST00000411494 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF423-202ENST00000535559 4201 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZSCAN31-202ENST00000396838 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 TSGA10-203ENST00000393483 3878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 NFYC-203ENST00000372652 2363 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 TNFRSF11B-201ENST00000297350 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 ARMT1-201ENST00000367294 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC113367.1-201ENST00000498453 532 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms