Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC084251.1-201ENST00000521867 382 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC084033.2-201ENST00000551532 967 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP52-208ENST00000576499 711 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4450-201ENST00000583589 65 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL691432.1-202ENST00000597891 502 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC005261.1-201ENST00000601567 712 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CPA2-201ENST00000222481 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 NLRC4-201ENST00000342905 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC8A1-203ENST00000403092 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY25P-201ENST00000558356 1505 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL122008.2-201ENST00000412915 570 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 MCHR2-AS1-204ENST00000452482 821 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC068042.1-201ENST00000482222 1148 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms