Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms