Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL035555.1-201ENST00000404462 1790 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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