Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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