Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHKAP35790 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CHKAP35790 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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