Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HLA-DQB1P01920 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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