Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
VAX2Q9UIW0 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms