Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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COL24A1Q17RW2 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
COL24A1Q17RW2 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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