Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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