Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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