Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms