Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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