Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 INTS4-211ENST00000535943 1382 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RALY-AS1-202ENST00000432859 610 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC012363.2-201ENST00000437837 555 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL031289.1-201ENST00000440100 471 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC023137.1-201ENST00000448241 308 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 ARAFP3-201ENST00000454154 490 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AF186996.8-201ENST00000463158 907 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC133435.1-201ENST00000498753 576 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL645949.1-201ENST00000510094 324 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC100849.2-201ENST00000518324 519 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC100849.1-203ENST00000518417 723 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LRTOMT-216ENST00000539271 570 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC024619.3-201ENST00000582196 323 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC018697.1-202ENST00000582650 592 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 STARD13-AS-247ENST00000610879 779 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC106872.12-201ENST00000622170 547 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 TMEM182-211ENST00000640575 1155 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RGS17-201ENST00000206262 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LINC00970-201ENST00000366408 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 OR6B1-201ENST00000408922 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 SPAG11A-205ENST00000434307 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 AC025062.1-201ENST00000465163 644 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 IAH1-205ENST00000482918 863 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NBR1Q14596 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms