Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN4AP35499 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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