Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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