Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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COL4A5P29400 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COL4A5P29400 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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