Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC139795.3-201ENST00000606358 541 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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