Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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