Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL138889.1-203ENST00000530000 6593 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADAMTS12-203ENST00000504830 8774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EFR3B-204ENST00000403714 7434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CACNB2-216ENST00000617363 4385 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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HERC1Q15751 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01910-201ENST00000582251 2637 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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