Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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