Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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