Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC027313.1-201ENST00000509159 1666 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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LINC00587B1AMM8 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 C2orf74-202ENST00000426997 879 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC092098.1-201ENST00000429245 874 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 RPL19P13-201ENST00000483119 583 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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LINC00587B1AMM8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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LINC00587B1AMM8 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
LINC00587B1AMM8 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 C12orf54-201ENST00000314014 887 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 CTH-201ENST00000346806 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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