Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC078886.1-201ENST00000549144 554 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF559-ZNF177-205ENST00000602856 419 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FAM30B-201ENST00000611556 397 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01002-219ENST00000632747 621 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 GNAI1-205ENST00000457358 1633 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P1-201ENST00000374336 1332 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL049734.1-201ENST00000422384 608 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP000474.1-201ENST00000441465 680 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CHRM3-AS1-201ENST00000444721 486 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ABCA9-AS1-201ENST00000458677 523 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC015909.1-201ENST00000509943 839 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AP003354.1-201ENST00000523791 533 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02325-203ENST00000554862 733 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC015911.8-201ENST00000592517 560 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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