Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
BORCS6Q96GS4 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms