Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF592-201ENST00000299927 7863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
COL24A1Q17RW2 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms