Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms