Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX9Q9Y5X1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms