Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms