Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG6Q9Y2V7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG6Q9Y2V7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms