Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP20Q9Y2K6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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