Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGSF9BQ9UPX0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms