Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
L1RE1Q9UN81 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L1RE1Q9UN81 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms