Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENND2AQ9ULE3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms